Неисправности энкодеров и линейных датчиков делятся на два типа: механические и электронные. Механические неисправности заключаются в повреждении стекла задающего диска или линейки, повреждении подшипников и направляющих, механическом повреждении датчика считывающей головки. Ввиду высокой точности данных приборов и отсутствия в свободной продаже необходимых комплектующих, ремонт механической части не представляется возможным. В случае выхода из строя электронной части ремонт возможен и целесообразен.